Архитектурный ансамбль Медведевой пустыни формировался более шести веков. За это время храмы и постройки неоднократно перестраивались и реставрировались, что является естественным для древних архитектурных памятников.
Большие реставрационные работы были проделаны в 19 веке в 1862 году, когда был заново оштукатурен и расписан храм Рождества Богородицы. В 1871 отреставрирована и по ходу перестроена верхняя часть колокольни. Имеется упоминание о ремонте храма в 1911 году.
С приходом Советской власти Медведева пустынь была закрыта и пришла в запустение, как следствие архитектурный ансамбль пришел в аварийное состояние, прогнила кровля, обрушился свод, сгорела Спасская церковь. Так что к приходу реставраторов в 1996 году это были руины, которые казалось невозможно уже восстановить.
Благодаря высокому профессионализму и таланту Германа Борисовича Бессонова, был сделан самый важный и трудный шаг в процессе возрождения Медведевой пустыни.
Много работы предстоит еще впереди: изнутри храм Рождества Богородицы не реставрирован, стены храма трещат из-за слабого фундамента, находящегося в аварийном состоянии; полы провалены, стены ни оштукатурены, ни расписаны; нет иконостаса и церковной утвари. Колокольня в плачевном и остро-аварийном состоянии, накренилась и, того смотри, упадет на храм. Но, с Божьей помощью и с помощью добрых и неравнодушных людей, двигаемся вперед в возрождении и реставрации одного из древнейших и красивых храмов Подмосковья.